<div dir="ltr"><div>Dear   Bálint,</div><div>Thanks so much for your reply.</div><div>sorry, I have checked and it was our MPI problem.</div><div>Best Regards,</div><div>Simin Pahlavi<br></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Tue, Sep 3, 2019 at 2:05 PM Bálint Aradi <<a href="mailto:aradi@uni-bremen.de">aradi@uni-bremen.de</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Dear Simin,<br>
<br>
> II have 2 questions and any help is appreciated. 1) I want to know<br>
> how to set input in order to write the trajectory of NPT md<br>
> calculation down , I mean to have also box information inside the<br>
> trajectory, for example pdb format.<br>
<br>
Currently, we output the lattice vectors in the md.out file.<br>
<br>
> 2) In non-scc-md run, some md steps is  written several times in xyz <br>
> output ( md iter  number is same for some written configurations in<br>
> xyz output file) . why? Are these belong to non converged<br>
> calculations or something like this?<br>
<br>
That's interesting, that should not be the case. I just tried a non-scc<br>
MD run, but can't reproduce your error. Is it possible, that you send me<br>
off-list a reproducable example, where it occurs?<br>
<br>
  Best regards,<br>
<br>
  Bálint<br>
<br>
-- <br>
Dr. Bálint Aradi<br>
Bremen Center for Computational Materials Science, University of Bremen<br>
<a href="http://www.bccms.uni-bremen.de/cms/people/b-aradi/" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.bccms.uni-bremen.de/cms/people/b-aradi/</a><br>
<br>
<br>
_______________________________________________<br>
DFTB-Plus-User mailing list<br>
<a href="mailto:DFTB-Plus-User@mailman.zfn.uni-bremen.de" target="_blank">DFTB-Plus-User@mailman.zfn.uni-bremen.de</a><br>
<a href="https://mailman.zfn.uni-bremen.de/cgi-bin/mailman/listinfo/dftb-plus-user" rel="noreferrer" target="_blank">https://mailman.zfn.uni-bremen.de/cgi-bin/mailman/listinfo/dftb-plus-user</a></blockquote></div>